1.アクセス
あなたのブラウザから、「http://〜〜〜」というURLを送信して、実行するCGIファイルをサーバーへ探しに行く。

2.実行
サーバーは指定されたCGIプログラムを内部から探し出し、入力されたデータを適合したCGIファイルへ送信する。

3.実行結果
CGIプログラムは、予め設定された処理を行い、結果をサーバーへ返す。

4.データを送る
CGIプログラムの実行結果を受け取ったサーバーは、その内容をブラウザへ送信する。

上記のような流れで、CGIプログラムは動作しております。
では、CGIプログラムとはどのようなものなのでしょうか？。
一言で言うならば、「各種命令文が書かれたテキスト文書」です（笑）。
どこかで、CGIプログラムファイル （ファイル名の拡張子が [ .cgi ] と、なっているものが多いです）
を入手したことがある方は、「メモ帳」で中身を開いてみましょう。
各種雑多な、タグのようなものが書かれていることに、気がつくことでしょう。
これがCGIプログラムの本体です。

CGIを書く言語には 「C言語」 などもありますが、
現在最も多く使われいるのものは 「Perl（パール）」 というものです。

[ Perl の特徴 ]
ここは読み飛ばしても構わないのですが、一応、参考の為に記述しておきます。

1. 初心者にも比較的わかりやすい
どのような言語であっても、文法が簡単な方が運用しやすいでしょう。

2. 高度なスクリプト言語である
正確にはPerlはプログラミング言語でありません。
プログラミング言語ほど、高度な処理が出来ないものとして「スクリプト言語」と呼ばれます。
しかし、実際Perlにはプログラミング言語と同等な機能を有しています。

3. コンパイルが不要
プログラミング言語を使用して書かれたソースは、ある程度の知識がある方なら、見るだけでその内容がわかります。
しかし、実際にはそのままではPCやサーバー上では動作しません。
人間が見てわかる言葉も、PCにとっては、全く意味をなさない言葉の羅列なのです。
よって、本来ならここで、PCにもわかるように「コンパイル（翻訳）」という、作業が必要になってくるのですが、
Perlの場合には、この「コンパイル」を自動的に行ってくれます。
実行の度に自動的にコンパイルをするので、若干処理速度は落ちますが、通常に使う分には気にならない程度ですし、
なによりコンパイル作業の手間が省けるので、プログラム実行までの作業が、ずっと楽になります。
★コンパイルが必要な言語を 「コンパイラ型言語」 、不要なものを 「インタプリタ型言語」 と呼びます。

4. 使用者が多い
多数決の原理です（笑）。
使っている方が多いという事は、それだけ利用範囲が広まりますし、
いただいたソースを改造する際や、わからないことがあった時に、
その方面の知識がある方も多いと言うことになります。

Perlによるプログラミングについては、とてもここでは書ききれませんので、
詳しく知りたい方は、Perlに関する書籍や、他のHPを参考になさって下さい。
ちなみに現在のPerlの最新ヴァージョンは 「 Perl5 」 になっております。